O Instituto Tecnológico Vale Desenvolvimento Sustentável (ITV DS) foi criado em 2009 e tem se consolidado como uma das instituições de pesquisa em desenvolvimento sustentável mais importantes da região Norte do país e mantém um curso de mestrado profissional recomendado pela CAPES e desenvolve pesquisas nas áreas de Biodiversidade e Serviços de Ecossistema; Genômica Ambiental; Tecnologia Ambiental; Geologia Ambiental e Recursos Hídricos; Socioeconomia e Sustentabilidade; e Computação Aplicada.
O ITV valoriza a diversidade e está comprometido com a criação de um ambiente acolhedor e de diálogo no qual todos se sintam incluídos independentemente da sua orientação sexual, suas diferenças culturais ou ideológicas, de opiniões, deficiências, gênero, cor, etnia, origem, convicções políticas, crenças religiosas, geração, estado civil.
Especialidade: Bioinformática (com graduação em Ciências da Computação, Ciências Biológicas ou áreas afins)
Localidade: Belém/PA (trabalho remoto com acesso frequente)
Carga horária semanal: 40 horas (dedicação exclusiva)
Modalidade de bolsa: Pós-Doutorado
Valor da bolsa: R$ 9.047,40
Duração da bolsa: 5 meses (prorrogável, com implementação prevista para setembro de 2024)
Período de inscrição: até 25/08/2024
Pré-requisitos obrigatórios:
- O candidato deve ter graduação em Ciências da Computação, Ciências Biológicas ou áreas afins, com experiência na área de Bioinformática por pelo menos quatro anos após a obtenção do diploma de graduação, e doutorado concluído.
- Familiaridade com os princípios estatísticos empregados na análise de dados transcriptômicos.
- Experiência com dados de RNA-Seq (Illumina) e análises de expressão gênica, preferencialmente de plantas.
- Experiência em ambientes GNU/Linux e uso de servidores HPC.
- Fluência nas linguagens de programação R e/ou Python.
- Familiaridade no uso de base de dados biológicos para integração e extração de conhecimento.
- Deve ter a capacidade de trabalhar em um ambiente interdisciplinar e colaborativo, bem como a capacidade de discutir questões e fornecer soluções para cientistas com diferentes formações.
- Excelente habilidade de comunicação verbal e escrita científica em português e inglês.
Pré-requisitos desejáveis:
- Experiência com dados de small-RNAs, especialmente microRNAs.
- Experiência com montagem de genomas complexos com dados de Illumina, Hi-C, PacBio e Nanopore.
- Experiência na construção e/ou manutenção de workflows de análises bioinformáticas.
- Experiência na análise de dados multi-ômicos e integração de dados biológicos.
- Experiência com dados de RNA-Seq long-reads (PacBio e Nanopore).
Atividades e responsabilidades:
- Desenvolvimento e execução de pipelines voltados para análises transcriptômicas, incluindo montagem de transcriptoma de novo, análises de expressão e co-expressão gênica diferencial e análises de enriquecimento funcional.
- Desenvolvimento e execução de pipelines voltados para a expressão de microRNAs, incluindo análises de expressão gênica diferencial e análises funcionais de genes alvo.
- Desenvolvimento e execução de pipelines para a integração de dados ômicos e construção de rede regulatórias e de co-expressão, com abordagens de Biologia de Sistemas.
- Interpretação de dados e produção cientifica (artigos, relatórios, etc.).
- O trabalho será remoto com acesso frequente ao prédio, isto é, o bolsista deverá morar em Belém, com a possibilidade de trabalhar de casa e ir ao ITV quando necessário.
Documentos obrigatórios:
- Diploma de graduação em Ciências da Computação, Ciências Biológicas ou áreas afins.
- Diploma de mestrado e doutorado.
- Carta de apresentação, com no máximo duas páginas, mencionando motivação e como as suas qualificações se enquadram ao escopo da vaga. Indicar o contato de pelo menos uma referência.
- Curriculum Vitae ou Currículo Lattes.
Os interessados devem enviar a documentação solicitada ao e-mail: amanda.vidal@itv.org
- Enviar os documentos para Amanda Vidal
- Título do email: Vaga Bioinfo ITV
- Dúvidas devem ser encaminhadas ao mesmo e-mail